Томас Андерсон ведет двойную жизнь: днем он работает в офисе, где его постоянно критикует начальство, а ночью становится хакером по имени Нео, способным проникнуть в любую часть интернета. Однако однажды его мир переворачивается, когда он открывает для себя шокирующую правду о реальности.

Нео, Тринити и Морфеус продолжают возглавлять борьбу человечества против армии машин. Они вынуждены использовать не только передовое оружие, но и свои уникальные навыки. Участвуя в миссии по спасению человечества от уничтожения, герои начинают глубже понимать природу Матрицы и осознавать ключевую роль Нео в судьбе мира.

Гордый афроамериканец и его супруга, преподающая в школе, переживают трудности, связанные с расовой несправедливостью в Америке 1960-х годов.