Фильм "Ботаны" рассказывает о молодых ребятах, которые по стечению обстоятельств оказываются в армии, а именно в спецроте «Кибер войск». На протяжении всей истории мы видим противостояние между солдатами, которые делают ставку на силу, выносливость и умение побеждать в рукопашных боях, и которых герои с пренебрежением называют «качками», и «ботанами» научной роты, убежденными, что современную войну выигрывают ум и точный расчет. Сочетание драматических и комичных моментов создает множество забавных ситуаций, делая фильм интересным для зрителей всех возрастов.

Алексей и Татьяна Казарины отправляются на отдых и снова оказываются втянутыми в детективную историю. В это время органы госбезопасности ожидают прибытия в Одессу особо опасного преступника, известного как Бухгалтер. По оперативным данным, он работает в МГБ и охотится за картотекой тайной румынской полиции, где, как предполагается, фигурирует его фамилия.

На пляже Алексей и Татьяна встречают старого сокурсника Леши, Влада, который тоже ищет эту картотеку. Есть подозрение, что она спрятана у главного авторитета Одессы - Миши Виртуоза. На пляже Влад случайно знакомится с Майей, которую Леша называет самой красивой девушкой Одессы. Влад сразу же оказывается под её чарами. На одном из совещаний Владу показывают фотографии членов семьи Виртуоза.

Влад, который настаивал на уничтожении всей семьи Виртуоза, видит среди фотографий Майю – его племянницу. До штурма остаётся совсем немного времени. Влад и Алексей проникают в особняк Виртуоза и умоляют Майю бежать, но она непреклонна – не оставит дядю ни при каких обстоятельствах.