Томас, подросток, приходит в себя в лифте, не помня ничего, кроме своего имени. Он оказывается среди других ребят, которые уже научились выживать в этом странном месте. Каждые 30 дней появляется новый мальчик. Они живут в «Приюте» уже три года, питаются тем, что удается вырастить, и безуспешно пытаются найти выход из лабиринта, окружающего их дом. Но однажды появляется девочка, находящаяся в коме, что меняет привычный порядок вещей.

После того как Томас, Тереза, Минхо и остальные глэйдеры успешно прошли через Лабиринт, они оказываются перед новыми, еще более опасными испытаниями. Руководство ПОРОКА, загадочной организации, организовавшей эти жестокие гонки на выживание, не дает им передышки. Теперь ребятам предстоит пересечь раскаленную пустыню и столкнуться с людьми, зараженными неизлечимой болезнью. Эти зараженные отличаются агрессивным и непредсказуемым поведением, что делает их путешествие еще более смертельно опасным.

Когда роботы поднимутся против человечества и начнут преследовать людей, цивилизация превратится в развалины.

Прошло несколько поколений с тех пор, как Цезарь был у власти. Обезьяны теперь доминируют на планете, живя в гармонии, в то время как люди вынуждены скрываться. Однако, когда новый деспотичный лидер обезьян начинает строить свою империю, молодой шимпанзе отправляется в путешествие, которое заставит его пересмотреть всё, что он знал о прошлом. В конечном итоге ему предстоит сделать выбор, который определит будущее как для обезьян, так и для людей.

Томас становится лидером группы оставшихся в живых глейдеров, направляясь на выполнение их самого рискованного задания. Чтобы спасти своих товарищей, им предстоит пробраться в таинственный Последний город — опасный лабиринт, находящийся под контролем ПОРОКа. Те, кто сумеет выжить в этом месте, наконец-то узнают все ответы на вопросы, преследующие их с момента попадания в лабиринт.