15-летний Дзюн Тэндо неожиданно оказывается в далеком загадочном прошлом, полном чудовищ, драконов и мистических сил. Путешествие переносит его на 1200 лет назад, где он узнает, что именно ему предстоит стать ключевой фигурой в спасении человечества и прекращении войны между людьми и демонами.

Во время задания по поимке хорька на Сакуру, Сикамару и Наруто нападают неизвестные ниндзя. Наруто оказывается отделён от своей команды и сталкивается с мощью, не связанной с Чакрой, а также узнает о древней исчезнувшей цивилизации. Воссоединившись с друзьями, Наруто оказывается перед необходимостью бороться за спасение всего мира.