Научная выставка изменила жизнь неуклюжего школьника Питера Паркера, когда его случайно укусил радиоактивный паук, наделивший его невероятными паучьими способностями. Трагедия настигла Питера, когда грабитель лишил жизни его любимого дядю Бена. Это событие заставило Питера принять решение использовать свои новые силы для защиты людей. В его памяти навсегда остались слова дяди: «С великой силой приходит великая ответственность!» Так Питер становится Человеком-Пауком, бесстрашным героем в маске.

События мультфильма разворачиваются в 1954 году. Храбрые супергерои оказываются перед сложной задачей - защитить Землю не только от человеческого зла, но и от космической угрозы. К нашей планете приближаются полчища злобных пришельцев. Супермен, Флэш, Зелёный Фонарь, Чудо-Женщина, Бэтмен и многие другие отважные защитники готовы пожертвовать своими жизнями ради спасения родного мира.