Пинки и Брейн — две лабораторные мыши, ставшие результатом научного эксперимента. Благодаря генетическим манипуляциям Брейн приобрел невероятный ум, а Пинки — почти безумие, но при этом остался невероятно забавным. Ночами они придумывают грандиозные планы, которые стараются воплотить с наступлением утра.

Их неугомонность и ночные авантюры имеют простое объяснение: чтобы придать смысл своему существованию, они дали себе полную свободу действий и стремятся перевернуть мир с ног на голову.

Когда лаборатория была разрушена, две подопытные мышки оказываются в руках девочки по имени Элмайра, которая приобрела их в зоомагазине. Теперь Брейн сталкивается с новыми трудностями на пути к мировому господству: девочка, не знающая меры в своей любви к животным, не слишком умный Пинки и отсутствие необходимого лабораторного оборудования.