Фильм рассказывает о приключениях команды клонов под номером 99, известной как «бракованная партия». Эти клоны отличаются от своих собратьев благодаря уникальным генетическим особенностям, каждая из которых наделяет их особыми навыками. Эти способности делают их не только высокоэффективными солдатами, но и грозной боевой единицей. После завершения своей службы, они начинают работать как наемники, стремясь найти своё место в стремительно меняющейся галактике.

После утраты всего, что ей было дорого, молодая Морган Элсбет решает посвятить свою жизнь мести. В это время Баррисс Оффи, когда-то принадлежавшая к ордену джедаев, старается найти своё место в стремительно изменяющейся галактике.