США, 1930-е годы. Из Чикаго отправляется поезд, пересекающий всю страну, который вскоре станет ареной борьбы двух гангстерских банд. В это время в Нью-Йорке учёный вместе со своей помощницей разыскивают исчезнувшие бутылки с эликсиром бессмертия.

Прошло десять лет с тех пор, как Мегатрон исчез, а Юникрон был побеждён. Автоботы и Десептиконы живут в шатком мире, совместно работая над разработкой мест добычи энергона. Кикер, молодой парень, который с детства, после встречи с Праймом, приобрёл способность чувствовать энергон, помогает находить его на Земле, на базе Автоботов под названием Ocean City. В это время неизвестные силы нападают на несколько укреплений Автоботов на Марсе и других планетах, посылая орды существ, напоминающих роботов-трансформеров. Элитная команда под предводительством Grand Convoy отправляется на поиски врага, но обнаруживает только развалины и решает вернуться на Землю, чтобы дать бой противнику там. Используя свои способности, Grand Convoy и его соратники успешно отражают нападение, но мудрый лидер понимает, что это лишь начало новой войны.