События фильма разворачиваются в 2036 году, спустя два десятилетия после того, как радиоактивное загрязнение в результате аварии на атомной станции превратило центральную часть Японии в пустыню, пропитанную радиацией. Благодаря достижениям генной инженерии появились люди, которые с самого рождения были устойчивы к радиации. Эти люди стали членами нового отряда спецназначения под названием «Коппелион». Три школьницы, входящие в этот отряд, отправляются в опустевший город Токио, чтобы найти выживших и выяснить истинные причины катастрофы, произошедшей двадцать лет назад.

Старшеклассник Тэппэй Кобаяси потерял родителей в автокатастрофе. Из родственников у него остался только дед, о котором в семье особо не говорили. И было почему — Иссин Арима, дед по матери, крепко держит рычаги японской экономики и является одним из мировых финансовых магнатов. Мать Тэппэя вышла замуж против воли отца, но Иссин смирился с решением дочери и не вмешивался в их жизнь. Теперь же, когда наследника из зятя не получилось, дед решил готовить внука к этой роли. Тем более, что Тэппэй, выросший вдали от больших денег, оказался не плейбоем или тепличным растением, а нормальным крепким парнем с отличным характером.

Однако прежде чем стать наследником, Тэппэю нужно пройти проверку и немного «обтесаться». Иссин переводит сменившего фамилию внука в академию, где учатся дети не просто богатых, а очень влиятельных людей, включая европейских монархов. Видного, способного и честного парня, принесшего в светскую жизнь свежий ветер, сразу же замечают первые красавицы академии — изящная принцесса Шарлотта, «рыцарь в юбке» принцесса Сильвия и «принцесса моды» супермодель Сэйка. Стоит отметить, что с каждой из них он познакомился при весьма романтических обстоятельствах. А еще у нашего Тэппэя есть личная служанка Ю!

В будущем миром правят молодежные банды, члены которых обладают сверхъестественными способностями. Их боятся как власти, так и обычные преступники, хотя иногда и сотрудничают с ними. Эти банды различаются по именам и цветам, соответствующим их стихиям. Пока в городе идет ожесточенная борьба между "красными" и "синими", на райском острове, где находится школа "Асинака", 17-летний Ясиро Исана, которого друзья зовут Сиро, мирно обедает в компании своей кошки. Однако, когда он отправляется в путь, его жизнь резко меняется: за ним начинают гнаться какие-то хулиганы, затем появляется странный меченосец, его кошка превращается в обнаженную красавицу, а сам Сиро узнает, что у него есть близнец-серийный убийца, с которым очень хотят встретиться члены Красной Банде и многие другие.

В Осаке происходит необычное соревнование, которое задумал сам Бог. Люди, подходящие для этого испытания по различным критериям, называются «Держащимися за руки». Эти участники могут вместе вызывать мистическое оружие под названием Нимрод, причем у каждой пары оно уникально. Пара, одержавшая победу в этом соревновании, получает возможность бросить вызов самому Богу, и если они выиграют, он выполнит любое их желание.

Даже благополучную Японию не обошел демографический кризис! В результате правительство решило изменить подход, и частная академия Осаи перешла на совместное обучение. В первый год эксперимента соотношение парней и девушек было едва 1 к 18, что сразу ощутил Такатоси Цуда, выбравший эту школу из-за её близости к дому. Президент школьного совета Сина Амакаса решила включить в состав представителя местного гендерного меньшинства, и Цуда оказался подходящим кандидатом – так всё и началось.

Теперь главный герой работает на благо академии вместе с тремя другими членами совета – откровенной, но немного закомплексованной Синой, опасной шутницей Арией и вспыльчивой гением-коротышкой Судзу.