«Миссия Дарвина» рассказывает о команде морских свинок, работающих на правительство США. Их подготовил ученый, чтобы они могли выполнять задания, недоступные для людей, используя передовые технологии.

В команду входят: Дарвин, который является командиром и специалистом по коммуникациям; Хуарес, единственная девушка в отряде и мастер боевых искусств; и Бластер, отвечающий за физическую силу. Вместе они должны сорвать планы злодея, стремящегося захватить мировое господство.