После великой победы на поле боя, лорды Васидзу и Мики, заблудившись в густом лесу, встречают загадочную старуху, которая предсказывает блестящее будущее для Васидзу и еще более великое для потомков Мики. Когда они выбираются из леса, их действительно вызывают к императору и награждают почетными званиями. Васидзу, подстрекаемый своей амбициозной женой, решает пойти дальше предсказаний старухи.

Фильм "Самурай 3: Поединок на острове" представляет собой мощное завершение эпической истории о доблести и чести Миямото Мусаси. После долгих лет борьбы за справедливость, Мусаси стремится к спокойной жизни, но его покой нарушает появление давнего врага — Сасаки Кодзиро. Судьба сводит их на острове Ганрью, где два великих воина готовятся к последнему, решающему сражению, которое определит их судьбы.

Мечта Иясу Токугавы стала реальностью - он и его сын Хидетада теперь правят Японией безраздельно. Однако не все согласны с этим, и последний оставшийся клан ниндзя продолжает предпринимать попытки устранить Иясу в его крепости Санпу.

Японский адмирал Исороку Ямамото, известный своей тактической гениальностью и преданностью императору, испытывает серьёзные сомнения по поводу вступления Японии в войну с Соединёнными Штатами. Несмотря на его категорическое несогласие с планом нападения на Пёрл-Харбор, его мнение остаётся без внимания. В итоге, Ямамото вынужден возглавить свои войска в этом судьбоносном сражении.