События сериала происходят в небольшом шахтерском городке на Урале. В советские времена этот город был «закрытым», так как на его шахте добывали уран. Сейчас город частично открыт, но по-прежнему туда никто, кроме местных жителей, не приезжает. Как и в любом маленьком городе, судьбы его обитателей тесно переплетены, а старые дома хранят множество тайн. Город расположен в некоторой изоляции: с одной стороны его окружает полукольцо гор, с другой – река. Единственный путь в город – мост.

Леша возвращается домой после службы в частях специального назначения. Город, который он покинул, почти не изменился. Кажется, что здесь ничего не происходит и не может произойти. Но в день его возвращения на шахте случается страшная авария. После этого в городе начинают происходить загадочные природные явления, ставя жителей в крайне опасные ситуации. Облака сгущаются, учащаются грозы без дождя, город окутывает невероятно плотный туман. Когда эти трудности удается преодолеть, горожане обнаруживают, что они в полной изоляции. Мост перекрыт военными, берега оцеплены, солдаты в химзащите. Все, что удается узнать, это одно слово: «Карантин». Жители ставят властям ультиматум: «С кем вы? С нами или с ними? Вы все еще власть, или вы одни из нас, и мы вместе против того, что происходит?»

Главной героине, 28-летней Ларисе Кирсановой, пришлось столкнуться с неожиданным ударом судьбы: ее свадьба сорвалась, так как жених, Павел Бестужев, внезапно исчез, не оставив никаких объяснений. Чтобы справиться с этим потрясением, Лариса отправляется на Балканы, где в разгаре русско-турецкая война, и начинает работать сестрой милосердия. После окончания войны она возвращается в Богородск, где живет ее тетушка и откуда родом Павел. Лариса решает выяснить, что же произошло с ее женихом. В Богородске она зарабатывает на жизнь, преподавая математику в гимназии. Однако помимо этого ей приходится заниматься расследованием преступлений, и со временем она приобретает репутацию бесстрашной амазонки, которой ее наделила молва.