Томас, подросток, приходит в себя в лифте, не помня ничего, кроме своего имени. Он оказывается среди других ребят, которые уже научились выживать в этом странном месте. Каждые 30 дней появляется новый мальчик. Они живут в «Приюте» уже три года, питаются тем, что удается вырастить, и безуспешно пытаются найти выход из лабиринта, окружающего их дом. Но однажды появляется девочка, находящаяся в коме, что меняет привычный порядок вещей.

После того как Томас, Тереза, Минхо и остальные глэйдеры успешно прошли через Лабиринт, они оказываются перед новыми, еще более опасными испытаниями. Руководство ПОРОКА, загадочной организации, организовавшей эти жестокие гонки на выживание, не дает им передышки. Теперь ребятам предстоит пересечь раскаленную пустыню и столкнуться с людьми, зараженными неизлечимой болезнью. Эти зараженные отличаются агрессивным и непредсказуемым поведением, что делает их путешествие еще более смертельно опасным.