Инопланетяне решили организовать масштабное нападение на мирный и благополучный Ретровилль! Пока Джимми наслаждался временем в луна-парке с друзьями, внезапно с небес спустились пришельцы и похитили всех родителей детей!

Сначала жизнь без строгих мам и пап казалась настоящим раем, но очень скоро ребята поняли, что без них стало невыносимо скучно и грустно. Джимми Нейтрон, полный решимости вернуть своих любимых родителей, принимает смелое решение освободить их из инопланетного плена. Вместе с верным киборгом-собакой, гениальный мальчик создаёт флот космических кораблей. На этих кораблях Джимми и его друзья, оставшиеся без родителей, отправляются в захватывающее межгалактическое путешествие, чтобы вернуть своих близких домой!