Семья Ямада живёт самой обычной жизнью: папа, мама, бабушка, сын Нобору и дочка Ноноко. Однако каждый день у них происходит что-то забавное и необычное. Например, Ноноко могут случайно забыть в супермаркете, или родители устраивают настоящие баталии за пульт от телевизора. А однажды бабушка решила приготовить необычный бефстроганов, что привело к неожиданным результатам.

Маленькая любопытная рыбка Поньо, дочь волшебника и прекрасной морской богини, решает покинуть свой подводный дом, чтобы узнать больше о жизни людей. В процессе своих приключений она попадает в банку и оказывается выброшенной на берег. Там её находит пятилетний мальчик по имени Сосукэ. Дети быстро становятся друзьями, и Поньо начинает мечтать о том, чтобы стать человеком.