Синдзиро Хаята — сын Сина Хаяты, который был первым Ультраменом, обладает уникальной силой. Однако он узнаёт об этом только после того, как на него нападают неизвестные. Ультрамен спасает Синдзиро и раскрывает, что он его отец. Синдзиро надевает костюм Ультрамена, предоставленный мистером Идом, бывшим членом Специального научного поискового отряда, и решает помогать отцу во всех начинаниях. Впереди их ждёт серьёзное сражение.