Лучшие подруги в одном мире, заклятые враги в другом. Мато Курой и её альтер-эго Блэк Рок Шутер предстоит пройти через множество испытаний, чтобы спасти самого дорогого ей человека, Ёми Таканаси, от самой себя и от Хозяйки Мертвых. История разворачивается параллельно в нашем мире и в альтернативной реальности, где лучшие подруги принимают образы Блэк Рок Шутера и Хозяйки Мертвых. В нашем мире преобладают эмоции и переживания, в то время как альтернативная реальность полна сражений и ярких пейзажей. Кульминация наступает, когда Мато решает отправиться на поиски пропавшей Ёми...

Жизнь молодого Ноктиса круто изменилась после нападения шестирукой женщины-змеи. Этот чудовищный монстр лишил его родных и едва не убил самого Ноктиса. Благодаря своевременной помощи ему удалось выжить и найти новый дом, но это спокойствие длилось недолго. Спустя несколько лет война между его королевством и империей завершилась победой последней. Ноктис, скрывая свою личность, пробирается в Столицу, которая оказалась под контролем врага, и вступает в нескончаемую борьбу с имперскими киборгами.