Фильм "Лабиринты разума" основан на реальных происшествиях, которые до сих пор остаются загадкой для современной науки. Каждая из восьми частей начинается с исторической справки: упоминаются личный астролог Гитлера, предсказания Григория Распутина и Нострадамуса. Актеры воссоздают события, поразившие весь мир, а исследователи и люди с необычными способностями предлагают свои интерпретации этих феноменов.

Летом 1941 года, Степа и Миша, юные ленинградцы, возвращаются домой из пионерского лагеря. В пути они встречают однорукого мужчину, который представляется как дядя Петя. Внезапная бомбардировка заставляет их разлучиться, оставив чемодан мужчины у мальчиков. Вернувшись в Ленинград, ребята открывают чемодан и обнаруживают внутри ракеты, которые фашисты используют для упрощения разрушения советских городов и сел. Понимая, что дядя Петя вовсе не фронтовик, а диверсант, друзья решают сами найти его и разоблачить.