События разворачиваются в 1999 году, еще до появления Зентреди. В результате падения инопланетного космического корабля на Землю была обнаружена сверхтехнология, из-за которой разразилась война между ООН и АнтиООН. Этот конфликт длился восемь лет, и за это время многие опытные пилоты погибли, уступив место совсем молодым.

Шин Кудоу, молодой пилот истребителя F-14 Tom Cat из военно-воздушных сил ООН, был сбит противником и потерпел крушение на уединенном тропическом острове Майян. Его нашли и выходили местные жители. По удивительному стечению обстоятельств, этот остров и его племя имеют связь с Протокультурой, которая, вероятно, была принесена на Землю в древние времена. Необычные энергетические явления на острове по своей природе очень близки к той самой сверхтехнологии, которую обнаружила ООН.

В далёком будущем человечество сталкивается с угрозой со стороны инопланетной расы Мазонов, которая начинает уничтожать людей. Земное правительство, однако, не предпринимает решительных действий для защиты и сохранения независимости, предпочитая сохранять статус-кво. В этой ситуации капитан Харлок вместе со своим экипажем и космическим кораблём «Аркадия» решает самостоятельно противостоять инопланетным захватчикам. Мазоны, исследовавшие Землю в древние времена, теперь считают её своей собственностью и стремятся захватить планету.

Богатый детектив Даисукэ Канбэ получает назначение в отдел по предотвращению преступлений, куда обычно отправляют всех проблемных полицейских. Его напарником становится Хару Като, с которым они поначалу не ладят, потому что Хару раздражает зацикленность Даисукэ на материальных ценностях. Но им придется найти общий язык, чтобы вместе раскрывать преступления.

Детектив-миллионер Даисукэ Канбэ поступает на службу в отдел по предотвращению преступлений, куда обычно направляют сотрудников с проблемами. Его новым напарником становится Хару Като, с которым у него сразу возникают трения из-за того, что Хару не нравится привязанность Даисукэ к богатству и роскоши. Однако им необходимо научиться работать вместе, чтобы успешно расследовать дела.

Каждый мужчина знает: либо занимайся девушкой, либо решай мировые проблемы! Стоило 17-летнему Синъити Кудо отвлечься на подозрительных личностей во время прогулки с подругой детства Ран Мори, как его схватили злодеи и заставили проглотить странную таблетку, превратившую его в семилетнего мальчика. Чудом уцелевший Кудо обратился за помощью к своему другу, но даже гениальный профессор Агаса оказался бессилен. Когда в дом профессора ворвалась взволнованная Ран и спросила незнакомого ребенка, кто он, бедняга смог лишь скользнуть взглядом по книжным полкам и вымолвить: «Эдогава... Конан».

Противостоять зловещему Черному Синдикату – задача не из легких, но герои и не думали сдаваться. Родители Кудо уехали из страны, а маленький Конан поселился в доме Мори вместе с любимой Ран и ее отцом Когоро, бывшим полицейским. Благодаря своему выдающемуся уму, связям Когоро и технической поддержке профессора, мальчик-детектив вместе с друзьями активно включился в расследование преступлений и борьбу с криминалом в Японии. Главный вопрос остается – сможет ли юный Эдогава разгадать все вражеские замыслы до того, как Ран поймет, кто на самом деле живет с ней под одной крышей?

Двенадцатилетняя Канна когда-то любила бегать, но после того, как её мама умерла, она потеряла к этому интерес. В октябре ей предстоит выполнить важное семейное задание: доставить дары из разных уголков Японии в святилище Идзумо для богов, которые там соберутся. В этом нелёгком деле ей будут помогать однокрылый кролик по имени Сиро и мальчик-демон Яся.

История рассказывает о молодом пилоте Хикару Ичидзё, его возлюбленной Мисе Хаясе и начинающей певице Линн Минмэй. Эти события разворачиваются на фоне жестокой войны между человечеством и Зентради — гигантами-мужчинами, обладающими огромным космическим флотом. Зентради и Мельтанди, гиганты-женщины, живут раздельно и враждуют друг с другом.

В ходе конфликта практически всё живое на Земле уничтожается, и выживают только экипаж и жители Макросса. В разгар войны Миса Хаясе и Хикару Ичидзё оказываются на опустошённой Земле, где находят город-крепость Протокультуры и передают сигнал Макроссу.