В альтернативной реальности Британская империя захватила треть мира, используя всю мощь своей военной машины для подавления непокорных народов.

В Японии, переименованной в Зону 11 после оккупации, живёт старшеклассник Лелуш вместе со своей младшей сестрой. Лелуш – изгнанный сын Императора, потерявший мать и право на престол. Он выделяется среди своих сверстников не только происхождением, но и выдающимися способностями, которые пока не нашёл где применить. Неожиданно он оказывается вовлечён в конфликт между японскими террористами и британскими солдатами, что приводит его к знакомству с таинственной девушкой по имени C.C. Она наделяет его сверхъестественной силой Гиас, позволяющей подчинять волю других людей.

Пряча своё лицо под маской и взяв имя Зеро, Лелуш присоединяется к подпольному движению, движимый жаждой мести Британии и своему отцу. Будучи студентом Академии Ашфорд, он вынужден вести двойную жизнь.

Офицер B.S.A.A. Крис Редфилд объединяет усилия с правительственным агентом Леоном С. Кеннеди и профессором Ребеккой Чемберс из Института биотехнологий. Вместе им предстоит противостоять безумному учёному Эриасу и его армии зомби.