1923 год. Вампиры живут среди людей уже долгое время, но в последнее время их количество резко возросло. Появился таинственный источник искусственной крови под названием Аскра. В ответ на это японское правительство создает специальное армейское подразделение «Код зеро», которому поручено уничтожить вампиров. Поиск врага возглавляет отряд вампиров под командованием генерал-лейтенанта Накадзимы, который ранее занимался информационной войной.

На деревню Наруто совершают нападение отступники-ниндзя, захватывая местных жителей в заложники. Их цель - получить эликсир под названием Вода героя, который временно увеличивает чакру в десять раз. В отсутствие Какаси Хатакэ, Наруто и его товарищам предстоит самостоятельно справиться с угрозой.