Паразиты — это существа, которые живут за счёт своих хозяев и обладают невероятной силой. Они посланы с небес и должны проникать в мозг человека, чтобы полностью контролировать его. Однако удача не всегда на их стороне. Именно из-за ошибки одного из паразитов школьнику Синъити Идзуми удаётся сохранить свою жизнь. Но эта же неудача превращает его в носителя загадочного существа, вынуждая Синъити постоянно бороться за выживание с другими, более мощными паразитами.

События разворачиваются в мире, где существует уникальная организация Охотников. Обладатели их лицензии пользуются множеством привилегий: бесплатные путешествия первым классом на различных видах транспорта, доступ к закрытой информации и возможность брать крупные кредиты в банках. Эти преимущества привлекают многих, желающих стать Охотниками. Каждый год проводится экзамен, на котором отбирают тех немногих, кто действительно заслуживает этого звания. Главный герой, Гон Фрикс, решает пройти этот экзамен, чтобы стать Охотником и найти своего отца. На своем пути он сталкивается с множеством испытаний и заводит верных друзей, у каждого из которых есть свои причины стремиться к этой цели.

Внезапно в различных частях мира начинают появляться разнообразные кайдзю. Исследователи из Международной организации, занимающейся мониторингом монстров, приступают к изучению этих необычных явлений.

Баки Ханма усердно тренируется, чтобы стать сильнее своего отца, признанного самым мощным бойцом на планете. Одновременно с этим пятеро самых опасных заключенных, приговоренных к смертной казни, совершают побег. Их единственная цель — сразиться с Баки и одержать победу.

Ники, четвёртая принцесса герцогства Дождя, обладающая редкой способностью вызывать дождь, отправляется в Солнечное королевство, чтобы выйти замуж за Ливиуса, короля Солнца, несмотря на то, что это противоречит её желаниям. По прибытии она с удивлением узнает, что король, покоривший весь мир за первые три года своего правления, на самом деле ещё ребёнок! Кроме того, Ливиус потребовал, чтобы Ники вызвала дождь по весьма тривиальной причине.