После множества сражений, значительных побед и горьких поражений команда профессора Ксавьера распалась. Однако новый тревожный сигнал поступает из Японии, и краткое расследование показывает, что угроза нависла не только над отдельными людьми, но и над судьбой всего мира. Это означает, что Циклоп, Шторм, Зверь и Росомаха должны снова сесть в иксоплан и отправиться на острова в район Тохоку, где их помощь особенно необходима. Исчезновение молодой мутантки Хисако оказывается лишь верхушкой айсберга, скрывающего куда более зловещий заговор.