В детстве Рюхэй Ода пережил ужасное событие — смерть старшего брата, и рядом с телом нашли загадочную метку. Спустя годы, Рюхэй увлекается кикбоксингом и пытается оставить прошлое позади. Однажды вечером, возвращаясь домой, его атакует пугающее существо, которое кусает его за ногу, и ночью у него начинаются странные видения. На следующий день на него снова нападают несколько таких существ, но на этот раз ему помогают два незнакомца, которые убеждают его присоединиться к отряду по борьбе с монстрами. Вскоре Рюхэй вновь сталкивается с той самой знакомой меткой.

Двое молодых, безусловно талантливых, учёных становятся единственными, кто способен спасти человечество от внезапной угрозы, когда Годзилла поднимается из глубин океана.

У подростков в возрасте от 12 до 16 лет начинают проявляться различные паранормальные способности. Среди них оказывается и Ю Отосака, который, несмотря на свои необычные таланты, ведет обычную школьную жизнь, стараясь не привлекать к себе лишнего внимания. Однако однажды он сталкивается с Нао Томори, и это встреча меняет его привычный образ жизни.

Сотрудник следственного отдела полиции Тотомару Иссики стремится раскрывать преступления и помогать людям, несмотря на недостаток опыта и навыков. По совету своего старшего коллеги, он решает обратиться за помощью к эксцентричному отшельнику Рону Камонохаси. Пять лет назад Рон был самым перспективным детективом в полицейской академии, но по неизвестным причинам внезапно исчез. Вместе они начинают расследовать серию убийств.

Среди гор Арарата тайная организация Аркам находит нечто, напоминающее Ноев ковчег. Один из отделов Пентагона стремится завладеть этим объектом, и только Спригган, специальный отряд Аркама, способен их остановить. Агентам Спригган, японцу Ю Оминаэ и французу Жан-Жаку Монду, предстоит объединить усилия, чтобы помешать американцам, возглавляемым полковником МакДугаллом — мальчиком с невероятными сверхъестественными способностями, использовать ковчег в своих интересах.