Однажды на деревню, где родился мальчик по имени Наруто, напал демон. Чтобы защитить поселение, его глава решил запечатать чудовище внутри Наруто, но сам при этом погиб. Прошли годы, и Наруто вырос. Теперь он гиперактивный и довольно неуклюжий ниндзя. Несмотря на то, что он продолжает жить в родной деревне, местные жители не проявляют к нему особой симпатии и стараются держаться подальше.

Юри Сибуя всю свою жизнь, а именно 15 лет, считал себя обычным подростком, который ходит в школу и увлекается бейсболом. Он и представить не мог, каким образом изменится его судьба, когда он увидит своего одноклассника Кэна, окруженного тремя хулиганами, и решит ему помочь.

Закончив обучение, Диего Вега возвращается домой и обнаруживает, что его родной край оказался под контролем военных сил. Не в силах мириться с такой несправедливостью, он принимает решение стать Зорро, чтобы защищать слабых и бороться за справедливость.

Наруто оказывается в тюрьме под названием «Кровавая тюрьма» после обвинения в покушении на жизнь Райкагэ и убийстве нескольких синоби. Он решает доказать, что не виновен в этих преступлениях.