Брэндон Хит стремится отомстить своему бывшему другу Гарри Макдауэлу, с которым они вместе вступили в преступный синдикат. Они были близки как братья, но однажды Гарри решил устранить Брэндона.

Нарушив главное табу алхимии и пытаясь вернуть к жизни свою мать, талантливые братья Элрики заплатили огромную цену: младший, Альфонс, потерял своё тело, и теперь его душа заключена в стальных доспехах, а старший, Эдвард, лишился руки и ноги, и вынужден использовать протезы - автоброню. Благодаря своим выдающимся способностям, Эдвард получил звание государственного алхимика, став частью военной структуры государства. Теперь у него появилась возможность вернуть Альфонсу его настоящее тело.

В загадочном театре странный клоун делится с ребенком волшебными историями о грядущих временах.

Наоми Армитаж и Росс Силибус живут под вымышленными именами на Марсе, воспитывая свою дочь Йоко. Их спокойная жизнь заканчивается, когда на одном из земных заводов по производству антиматерии вспыхивает восстание роботов. Армитаж обнаруживает, что это восстание служит прикрытием для скрытия информации о создании новых роботов «третьего типа».

Наоми отправляется на Землю, чтобы разоблачить тех, кто стоит за этим зловещим планом. В ходе своего расследования она сталкивается с самым мощным противником, которого ей когда-либо приходилось встречать: собственными копиями.