Много веков назад разразилась эпическая и беспощадная война за господство во Вселенной между двумя расами супер-трансформеров — доблестными Автоботами и коварными Дисептиконами. Их силы были примерно равны, и ни одна из сторон не могла одержать окончательной победы.

Но неожиданно в этот конфликт вмешалась третья сила — «зеленая армада» трансформеров Мини-Конов, способных нарушить хрупкое равновесие. Теперь судьба сражения зависит от того, кого выберут Мини-Коны в качестве своих союзников.

Прошло десять лет с тех пор, как Мегатрон исчез, а Юникрон был побеждён. Автоботы и Десептиконы живут в шатком мире, совместно работая над разработкой мест добычи энергона. Кикер, молодой парень, который с детства, после встречи с Праймом, приобрёл способность чувствовать энергон, помогает находить его на Земле, на базе Автоботов под названием Ocean City. В это время неизвестные силы нападают на несколько укреплений Автоботов на Марсе и других планетах, посылая орды существ, напоминающих роботов-трансформеров. Элитная команда под предводительством Grand Convoy отправляется на поиски врага, но обнаруживает только развалины и решает вернуться на Землю, чтобы дать бой противнику там. Используя свои способности, Grand Convoy и его соратники успешно отражают нападение, но мудрый лидер понимает, что это лишь начало новой войны.

Компьютерный мир Земли находится на грани полного краха. Джек Холистер, сын легендарного изобретателя, вынужден вступить в борьбу с последним творением своего отца — компьютерным мозгом по имени Киброн и его приспешниками, оборотнями цифрового мира. Чтобы справиться с этой угрозой, был создан отряд отважных скайеров. Джек Холистер, лидер небесных рыцарей, и его верные товарищи — Станс, Айс, Фостер и Лозер — объединяются, чтобы противостоять надвигающейся опасности и спасти человечество.

После того как лейтенанта Гаджета приняли в ряды Мировой Организации Больших Полномочий (МОБП), он начинает активно бороться с преступностью. В этом ему помогают два механических ассистента, известные как Гаджетины.