2045 год. После крупного экономического кризиса, известного как Синхронизированный глобальный дефолт, стремительно развивается искусственный интеллект, и человечество погружается в состояние, которое называют Устойчивой войной.

Бывшие сотрудники 9-го отдела становятся наёмниками и перемещаются по опустошенному войной и солнцем западному побережью США. Во время своих странствий они сталкиваются с новой, невиданной ранее угрозой — постчеловеком, существом, которое по всем характеристикам значительно превосходит киборгов.

Синдзиро Хаята — сын Сина Хаяты, который был первым Ультраменом, обладает уникальной силой. Однако он узнаёт об этом только после того, как на него нападают неизвестные. Ультрамен спасает Синдзиро и раскрывает, что он его отец. Синдзиро надевает костюм Ультрамена, предоставленный мистером Идом, бывшим членом Специального научного поискового отряда, и решает помогать отцу во всех начинаниях. Впереди их ждёт серьёзное сражение.