После смерти приемного отца юный Сиро Эмия жил один в огромном поместье. Выросший 16-летним парнем, он стал добрым, трудолюбивым и хозяйственным, поэтому его окружали заботой сразу две девушки — школьная подруга Сакура Мато и учительница Тайга Фудзимура, которая формально была его опекуном, но фактически скорее старшей сестрой. Все изменилось, когда Сиро узнал, что его родной город Фуюки является ареной магической битвы за Святой Грааль, которая повторяется раз в несколько поколений. Однако мир ускоряется, и с последней войны прошло всего 10 лет — и уже настало время новой.

Согласно древним законам, в этой «королевской битве» участвуют семь Мастеров-магов, каждый из которых вызывает Слугу — одного из великих героев прошлого или будущего. Последний оставшийся Мастер получает Грааль — величайшее сокровище, исполняющее любое желание. Правил нет, цель оправдывает средства, и вчерашний друг может стать соперником, предать и ударить в спину. Узнав правду, Сиро оказывается перед трудным выбором — уйти и отказаться от борьбы или рискнуть и поставить на карту все: свой небольшой (как он считает) магический дар, горячее сердце и отчаянное желание спасти всех, кто ему дорог. Но решающим фактором станут зеленые глаза из далекого прошлого, засиявшие той самой ночью.

Жизнерадостная и неунывающая двенадцатилетняя Акари Тайо стремится овладеть искусством чтения Таро, как это делала её рано ушедшая мать Хината. Изучая тонкости гадания в салоне госпожи Набатаки, девочка усвоила важный урок: «карты могут лишь направлять, но не принуждать». Дурные поступки совершаются из-за слабостей и тёмных чувств, которые скрыты в каждом человеке. В этом мире те, кто поддаются искушению, заболевают Демонией – ужасной болезнью, которая усиливает внутреннее зло и толкает на убийство, окончательно поглощая душу. Набравшись горького опыта, Акари поняла, что в одиночку многого не достигнешь – необходимо развивать собственные силы, иначе никого не удастся спасти. Так она оказалась в Сефиро Фиоре – тайной организации, которая издавна борется с демоническими силами, используя способности, даруемые старшими арканами Таро.

Двое магов получают задание отыскать и извлечь семь древних артефактов, в которых заключены жизненные силы легендарных духов. Чтобы помочь им в этом нелегком деле, магический совет вручает им особые волшебные жезлы. Эти жезлы позволяют магам превращаться в воительниц и усиливать свои магические способности. Однако между магами царит напряженность, и после очередного конфликта жезлы решают покинуть своих владельцев в поисках новых хозяев. Их выбор падает на двух современных школьниц.

Братья Хосино прибывают в небольшой городок Ямабико с целью улучшения здоровья младшего брата Аюму, которому всего 13 лет. Старший брат, 17-летний Кадзума, должен присматривать за ним. Их отправили в этот горный регион не случайно – здесь находятся корни их семьи, и родители планируют вскоре вернуться на родину. Однако этот процесс займет время, поэтому братья временно остановились в традиционной гостинице-рёкане, принадлежащей подруге семьи, госпоже Ёродзу. Несмотря на любовь к младшему брату, Кадзума не совсем представлял, чем будет заниматься в сельской местности, пока Аюму восстанавливает силы, наслаждаясь свежим горным воздухом и питательной едой.

Обычный японский подросток Сиро Эмия жил себе спокойно в родном городе Фуюки, пока внезапно не оказался втянутым в войну между Мастерами-магами за Святой Грааль. Маг из Сиро был так себе, и шансы на выживание казались невелики. Но смерть еще не на пороге, а его союзница – белокурая красавица Сэйбер – уже рядом, и общение с ней куда приятнее! К тому же, школьная королева Рин Тосака неожиданно оказалась коллегой-Мастером и отличной девушкой. Правда, ее слуга Арчер – тот еще зануда, но это можно стерпеть.

Сиро не стремился к главному призу и категорически не хотел никого убивать, но, как говорится, на войне как на войне. Раз нельзя избежать, значит, нужно возглавить. Вот так наш герой и ввязался в борьбу за Грааль.

Эмия Сиро - молодой маг, обучающийся в Академии Хомурахара в городе Фуюки. Однажды он становится свидетелем битвы между сверхчеловеческими существами, сражающимися за Святой Грааль. Этот ритуал требует, чтобы маги призывали Мастеров и их слуг для участия в сражении. Сиро решает помешать главному злодею завладеть Граалем и спасти невинных жителей города. Однако ситуация выходит из-под контроля, когда загадочная Тень начинает хаотично убивать людей в Фуюки, сея хаос и разрушение.

Идет ожесточенная битва за Святой Грааль. Сакура Мато, не в силах справиться с тяжестью своих поступков, превращается в темную сущность. Сиро Эмия, несмотря на знание всей правды, решает защищать её до последнего вздоха. Он намерен следовать своему пути справедливости до самого конца. Вместе с Рин Тосакой он стремится положить конец войне за Святой Грааль.

Война за Святой Грааль представляет собой эпическое противостояние, в котором маги и вызванные ими легендарные герои прошлого сражаются насмерть ради исполнения единственного желания.

Сиро Эмии оказался в крайне затруднительном положении: в ход событий вмешивается загадочное существо в маске, а его верная союзница, Слуга Сэйбер, исчезает. Война, казалось бы, уже проиграна, но он не может просто так сдаться, ведь битва магов угрожает жизням обычных людей. В это время Дзокэн Мато, маг, который до этого момента лишь наблюдал за происходящим, решает действовать.

Так продолжается история искажённой и безумной Войны за Святой Грааль, неразрывно связанной с судьбой Сакуры Мато.