В недалёком будущем на Землю обрушиваются атаки монстров, которых позже называют Врагами человечества. Чтобы противостоять этой угрозе, создаются специальные школы для подростков с уникальными способностями. Но среди этих одарённых учеников оказывается один совсем обычный человек, которому предстоит одолеть Врагов человечества, опираясь лишь на свой ум.

События разворачиваются в 2019 году. Тридцать лет назад был принят Закон о Развитии СМИ, который позволил Вооружённому Секретному Подразделению Развития ввести цензуру на книги под предлогом защиты прав человека и молодёжи от негативного влияния. В ответ на это был принят Закон о Свободе Библиотек, который дал местным властям право разрешать библиотекам сопротивляться центральному правительству. Конфликт между библиотеками и Комитетом Развития СМИ обострился до такой степени, что перерос в вооружённое противостояние. В 31-й год эры Сейка Ику Касахара оказывается в центре этого конфликта.

Три года назад человечество узнало о существовании существ, похожих на людей. Попытки мировых правительств скрыть их присутствие не увенчались успехом. Чтобы способствовать интеграции этих существ в человеческое общество, была запущена программа культурного обмена между видами.

Мия, наполовину человек, наполовину змея, представляет вид Ламий. Когда она приехала в Японию, её случайно поселили вместе с парнем по имени Курусу Кимихито. Проведя с ним некоторое время, Мия осознаёт, что влюбилась в него, и не скрывает своих чувств. Однако закон запрещает романтические отношения между разными видами.

Выпускник школы Банри Тада полностью утратил память после случайного падения с моста. В момент происшествия его душа покинула тело, и появился «Призрак Банри Тады» — бесплотный дух, который сохранил все воспоминания до момента падения. Спустя год после этого несчастного случая, Банри успешно поступает в один из университетов Токио. Впервые оказавшись в столице, он чувствует себя потерянным и ошеломленным шумом и суетой огромного города, оторванным от семьи и старых друзей.

Жила-была девочка, которая обожала любоваться океаном. Однажды её мама сильно заболела, и девочка отправилась искать помощи за море, в далёкое королевство, где, как говорили, живут защитники справедливости Яттермэны. Но её туда не пустили, и мама девочки умерла без помощи, так и не услышав доброго слова.

В известной банде воров Доронбо была красавица по имени Дорондзё, которая вместе с двумя своими помощниками, Бояки и Тондзурой, постоянно вступала в схватки с местными супергероями — Яттермэнами. Это их история. А также история двух подростков, Гана и Аи, которым вскоре предстоит стать настоящими Яттермэнами.

Жизнь молодого Ноктиса круто изменилась после нападения шестирукой женщины-змеи. Этот чудовищный монстр лишил его родных и едва не убил самого Ноктиса. Благодаря своевременной помощи ему удалось выжить и найти новый дом, но это спокойствие длилось недолго. Спустя несколько лет война между его королевством и империей завершилась победой последней. Ноктис, скрывая свою личность, пробирается в Столицу, которая оказалась под контролем врага, и вступает в нескончаемую борьбу с имперскими киборгами.