Однажды Нахо Такамия получает письмо от самой себя, только из будущего, где она старше на десять лет. В этом письме подробно описаны события, которые еще не произошли, включая перевод нового ученика, Какэру Нарусэ, в ее класс.

В письме взрослая Такамия многократно подчеркивает, что она сожалеет о многих своих решениях и хочет изменить прошлое, надеясь, что Нахо сможет принять правильные решения, особенно в отношении Нарусэ. Прочитав письмо до конца, Нахо узнает, что через десять лет Какэру больше не будет рядом с ними. Будущая Нахо настоятельно просит уделять особое внимание Какэру, так как она не хочет потерять столь важного для нее человека.

Принцесса Анисфия всегда мечтала о полетах, хотя сама не владеет магическими способностями, несмотря на то, что в прошлой жизни у неё всё было иначе. Она решает отказаться от престола и полностью посвятить себя созданию новой науки — магикологии. Однажды Анисфия становится свидетелем того, как её брат Альгард публично разрывает помолвку с Юфиллией, которая была навязана ему по политическим причинам.

Япония, середина XIX века. Конец многовековой изоляции, время бурь и потрясений, последние годы правления сегуната Токугава. Столкновение западных знаний и восточной мудрости взбудоражило умы и породило новые идеи – иногда весьма опасные. Это в полной мере ощутил на себе Кодо Юкимура – известный целитель, обучавшийся у голландских специалистов. После очередного приглашения в столицу доктор Юкимура бесследно исчез. Его дочь Тидзуру, не в силах мириться с неизвестностью, переоделась в юного самурая, взяла фамильный меч-кодати и отправилась в Киото на поиски отца.