Люди Икс стараются привыкнуть к жизни без профессора Ксавье. Лидерство Скотта Саммерса вызывает неоднозначные чувства среди членов команды, и сам Циклоп испытывает трудности в своей новой роли. Джин Грей беременна и предлагает мужу уйти из команды, чтобы воспитывать ребенка в более спокойной обстановке. После предполагаемой гибели Ксавье отношение к мутантам улучшилось, и ООН официально признала команду супергероев. Однако не все люди готовы к мирному сосуществованию.

История рассказывает о жизни 14-летней девочки по имени Сэйди Хоторн, которая учится в средней школе и увлекается натуралистикой. Её страсть — наблюдение за поведением животных. Но Сэйди не ограничивается только этим; она также применяет свои навыки к изучению человеческих взаимоотношений и повседневной жизни окружающих её людей.

Перемены неизбежны. Человечество вступило в новую фазу своего развития. Это эпоха Детей Атома, хомо-супириарс — людей с необычными и удивительными способностями, вызванными изменениями в их генетическом коде. Некоторые из этих мутантов убеждены, что им суждено управлять миром, и считают, что столкновение между ними и обычными людьми неизбежно. В то же время, другая группа мутантов, несмотря на ненависть и непонимание со стороны общества, которое они стремятся защитить, борется за предотвращение генетической войны. Эти защитники известны как Люди Икс.