История фильма "Исход: Цари и боги" основана на Ветхом Завете и рассказывает о великом пророке Моисее и его миссии по освобождению еврейского народа из египетского рабства. В те времена фараон издал указ, по которому всех новорожденных мальчиков еврейского происхождения следовало убивать. Чтобы спасти своего сына, мать Моисея положила его в корзину из тростника и пустила по течению Нила.

Корзину с малышом обнаружила дочь фараона, которая решила усыновить ребенка и воспитывала его вместе с Рамсесом, будущим фараоном. Спустя много лет, когда Моисей стал взрослым, он вынужден бежать из Египта. Однако позже он возвращается по воле Господа, чтобы освободить свой народ из рабства и привести его к свободе.