34-летний Сусуму Накоси некогда трудился в страховой компании, а теперь живёт на улице, ночует в машине и страдает от амнезии, не чувствуя эмоций. Однажды студент-медик Манабу Ито убеждает его принять участие в необычном эксперименте, который включает сверление отверстия в черепе. Сусуму соглашается, и после операции обнаруживает удивительное: закрывая правый глаз, он начинает видеть гомункулов левым глазом.