Мегамозг – самый умный и одновременно самый неудачливый злодей на планете. Годы он пытался захватить Метро-Сити, придумывая всевозможные хитроумные планы. Однако каждый раз его усилия рушились из-за вмешательства супергероя Метро-Мэна. Но однажды злодей убивает своего извечного врага, и внезапно Мегамозг остается без главной цели в жизни. Теперь он суперзлодей без супергероя.

В поисках выхода из этой ситуации он решает создать нового супергероя, которого называет Титаном. Но Титан выбирает путь зла, полагая, что быть злодеем намного интереснее. Однако его амбиции идут дальше – он хочет не просто править миром, а уничтожить его. Теперь перед Мегамозгом стоит непростая задача. Сможет ли он, злой гений, превратиться в героя и спасти человечество?