Когда Никита была крайне проблемным подростком, её спасло от смерти секретное американское агентство, известное как Подразделение. Они инсценировали её казнь и дали ей шанс начать жизнь с чистого листа, предложив возможность служить своей стране. Однако Никите не сказали, что её готовят стать шпионкой и убийцей. В итоге её предали, и все её надежды рухнули из-за людей, которым она доверяла.

После трёх лет в бегах Никита решает отомстить и ясно даёт понять своим бывшим начальникам, что не остановится ни перед чем, чтобы разоблачить и уничтожить их тайную организацию. Тем временем Подразделение продолжает вербовать и обучать молодых людей, стирая любую информацию об их прошлом и превращая их в хладнокровных и опытных убийц. Одна из новых рекрутов, Алекс, начинает осознавать, что её ждёт, и почему легендарная Никита решилась на отчаянный побег.

Коул, бывший преступник из мрачного постапокалиптического будущего, был осужден за дерзкое поведение и неподчинение властям. В 2015 году смертоносный вирус уничтожил почти всё человечество, а выжившие вынуждены были скрываться под землей. Ученые того времени уже разработали технологию перемещения во времени и решили использовать Коула в качестве подопытного. Ему поручили отправиться в прошлое, чтобы предотвратить распространение вируса, в обмен на полное прощение всех его преступлений.

Трое друзей — Вилл, Джей и Тайлер — решают покататься на роликах в залах нью-йорского музея. Их безобидная шалость оборачивается катастрофой, когда в здании происходит взрыв. Камеры наблюдения фиксируют Джея и Тайлера, и они становятся основными подозреваемыми в теракте. Вилл же бесследно исчезает.

Скрываясь от полиции, друзья находят убежище в поместье отца Тайлера. Отец решает помочь ребятам и нанимает влиятельную компанию, чтобы те могли покинуть страну. Тайлер доверяет своему отцу, однако агент, которого он нанял, вызывает у них подозрения. Самым большим вопросом остается судьба Вилла: его не видно на записях с камер, все его вещи исчезли, и нет никаких совместных фотографий. Вилл Тревелер словно никогда не существовал. Тайлер и Джей начинают подозревать, что он как-то причастен к произошедшему...

Джим Уинтерс, потерявший жену, живет вместе с двумя сыновьями в пригороде Нью-Джерси. Его младший сын Пит сталкивается с проблемами слуха, что приводит к трудностям в школе. Старший сын Гэйб, успешный ученик и любимец одноклассников, устал от провинциальной рутины. Сам Джим все еще не может оправиться после утраты, но встреча с новой женщиной приносит перемены не только в его жизнь, но и в жизнь его сыновей.

Психиатр Джейн Мэтис начинает испытывать сомнения в своем психическом здоровье после начала работы с новой пациенткой, в которой явно присутствует активное зло.

Во время поездки по США на автодоме, семья Картеров попадает в аварию и оказывается в загадочной зоне, пострадавшей от ядерных испытаний и отрезанной от остального мира. Вскоре они понимают, что эта, казалось бы, пустынная территория населена кровожадными мутантами. Эти существа начинают охотиться на Картеров, превращая их путешествие в борьбу за выживание.

Люди Икс, возглавляемые профессором Чарльзом Ксавьером, сталкиваются с серьезной угрозой в лице их возрожденной коллеги. Джин Грэй, вернувшись к жизни как Тёмный Феникс, становится угрозой не только для себя, но и для всех мутантов и человечества.