В последние дни Второй мировой войны камикадзе Коити Сикисима посадил свой самолёт на острове Одо, где находилась ремонтная база императорской армии Японии. В тот же вечер на них напал огромный ящер Годзилла, как его называли местные жители.

Коити возвращается в разрушенный бомбардировками Токио: родители погибли, от дома остались лишь обломки. Он пытается начать жизнь заново. К нему присоединяется девушка, тоже потерявшая семью, с младенцем, которого она спасла во время воздушного налёта. Время идёт, жизнь постепенно налаживается. Коити находит работу в команде по обезвреживанию мин в Токийском заливе. Однажды их хлипкий деревянный катер сталкивается с Годзиллой, который после ядерных испытаний на атолле Бикини стал ещё больше и свирепее.