Фильм "Самурай 3: Поединок на острове" представляет собой мощное завершение эпической истории о доблести и чести Миямото Мусаси. После долгих лет борьбы за справедливость, Мусаси стремится к спокойной жизни, но его покой нарушает появление давнего врага — Сасаки Кодзиро. Судьба сводит их на острове Ганрью, где два великих воина готовятся к последнему, решающему сражению, которое определит их судьбы.

Перед смертью Сайзу успевает открыть своей дочери Юри правду о её происхождении: она была усыновлена и на самом деле является дочерью мятежного правителя Юкимуры. Сын Сайзу клянётся защищать свою сводную сестру-принцессу и в итоге присоединяется к повстанцам, чья цель — ослабить власть сегуната Токугава.