Во второй части из пяти, рассказывающих о жизни на Земле в конце 40-го века от Рождества Христова, астронавты, пережившие катастрофу звездолета, оказываются в плену у устрашающих человекоподобных обезьян. Все думали, что на этом их история закончится.

Людям пришлось пройти через множество испытаний, но в итоге Брент, самый способный и удачливый из них, отправляется на поиски своих товарищей. Он знает, что небольшие группы людей, изменившихся после атомного взрыва, скрываются в строго засекреченном подземном городе и не желают вступать в контакт с внешним миром.

Космический корабль приземляется у побережья США, и на его борту обнаруживают трёх обезьян. Это вызывает удивление, ведь когда-то этот звездолёт был отправлен в космос с людьми на борту. Но настоящий шок наступает, когда обезьяны начинают говорить. Оказывается, что на Землю прибыли обезьяны-учёные: Зира, Корнелиус и доктор Мило.

Двадцать лет спустя после того, как Зира и Корнелиус сбежали с Планеты Обезьян, на Земле исчезли все собаки и кошки. Люди начали заводить обезьян вместо домашних питомцев, а затем, заметив их способность быстро учиться, начали обучать их выполнять простую работу по дому. К 1991 году Америка превратилась в страну, где обезьяны стали рабами. Владелец цирка Армандо приезжает в город с Цезарем, единственным сыном обезьян из будущего, которого считали погибшим. Армандо попадает в руки властей, решивших продолжить дело Зиры и Корнелиуса. Цезарь, потрясенный жестокостью и несправедливостью, с которой сталкиваются его сородичи, использует свой высокий интеллект и способность говорить, чтобы противостоять этому миру.

Будущее приносит множество новых угроз как для людей, так и для обезьян. Под угрозой оказывается само существование этих биологических видов. Постепенно становится ясно, что только совместные усилия и переход на новый уровень взаимодействия могут дать шанс на спасение планеты в предстоящих катастрофах.