Прошло два года с тех пор, как Вилли был выпущен на свободу. Во время летних каникул Джесси вместе с родителями отправляется на побережье, где местные жители часто наблюдают одинокую косатку. Воссоединение старых друзей было радостным, но длилось недолго: старый танкер сел на мель, и утечка нефти из судна поставила под угрозу жизнь Вилли и всех обитателей океана.

Старый Пит, почти достигший столетнего возраста, хранит в себе историю своего индейского племени. Его 17-летний внук Шейн, который состоит в уличной банде «Псы-воины», далек от этих традиций. Однако, задолжав своим товарищам по банде крупную сумму денег, Шейн соглашается отвезти дедушку на ежегодный совет племен, который проходит в Нью-Мексико, за много сотен миль от их дома в Южной Дакоте. Во время этого долгого путешествия Пит рассказывает внуку легенды своего племени, которые Шейн должен будет запомнить и передать будущим поколениям. Эта поездка навсегда изменит жизнь Шейна, наполнив ее новым смыслом и пониманием своих корней.

Фильм рассказывает об истории освоения американского Запада и сопротивлении коренного населения, защищавшего свои права. Одним из ключевых эпизодов является кровопролитие на ручье Вундед-Ни, которое стало последним крупным вооруженным противостоянием между племенем сиу и армией Соединенных Штатов. Этот трагический момент стал одной из завершающих страниц Индейских войн.

Однажды китобой, занимающийся незаконным промыслом, решает взять с собой в море своего маленького сына, чтобы научить его убивать китов. Но судьба распорядилась иначе – он сам становится объектом охоты кита-убийцы. Лишь дружба мальчика с косаткой спасает китобоя от неминуемой гибели.